Архиепископ Иоган Канизсай основал в австрийском городе Айзенштадт церковь францисканцев. В 1529 году во время войны с Османской империей церковь была разрушена, а граф Николаус Эстерхази восстановил её уже в барочном стиле. В 1630 году храм освятили в честь святого Иоанна и передали францисканскому ордену.
В интерьере церкви внимание привлекают не только красивые алтари, но и выполненная итальянскими мастерами эпохи Ренессанса триумфальная арка. Здесь повсюду много роскошной лепнины, а штукатурка на стенах кое-где имеет позолоту. В 1752 году в стиле рококо здесь была сооружена кафедра. В 1768 году произошёл пожар, после которого в результате реставрации храм обрёл три этажа. Здесь установлен орган, на котором играл сам Гайдн. На втором этаже церкви расположен епархиальный музей, появившийся здесь в 1981 году. В восточной части здания находится семейный склеп Эстерхази.